Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ino80Q6ZPV2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ino80Q6ZPV2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ino80Q6ZPV2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ino80Q6ZPV2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms