Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smpd4Q6ZPR5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smpd4Q6ZPR5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms