Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Opn5Q6VZZ7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Opn5Q6VZZ7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms