Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja6Q6S5G4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gja6Q6S5G4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gja6Q6S5G4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms