Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp1a3Q6PIC6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atp1a3Q6PIC6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp1a3Q6PIC6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms