Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup98Q6PFD9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup98Q6PFD9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nup98Q6PFD9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup98Q6PFD9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms