Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc85bQ6PDY0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms