Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dtx4Q6PDK8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dtx4Q6PDK8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms