Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc3bQ6PDC0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3bQ6PDC0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3bQ6PDC0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms