Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhb9Q6PB60 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bhlhb9Q6PB60 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhb9Q6PB60 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms