Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcf1Q6P542 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcf1Q6P542 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms