Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Podnl1Q6P3Y9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Podnl1Q6P3Y9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms