Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrimpolQ6P1E7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrimpolQ6P1E7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms