Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpbp1Q6NXH3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpbp1Q6NXH3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpbp1Q6NXH3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms