Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc66Q6NS45 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc66Q6NS45 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc66Q6NS45 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms