Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tpm4Q6IRU2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm4Q6IRU2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms