Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt87Q6IMF0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt87Q6IMF0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt87Q6IMF0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt87Q6IMF0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt87Q6IMF0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt87Q6IMF0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt87Q6IMF0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt87Q6IMF0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt87Q6IMF0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt87Q6IMF0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt87Q6IMF0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt87Q6IMF0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt87Q6IMF0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt87Q6IMF0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt87Q6IMF0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt87Q6IMF0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt87Q6IMF0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt87Q6IMF0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms