Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt40Q6IFX3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt40Q6IFX3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms