Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hecw2Q6I6G8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Hecw2Q6I6G8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hecw2Q6I6G8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms