Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6GQU0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6GQU0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6GQU0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6GQU0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6GQU0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6GQU0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q6GQU0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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