Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scaf8Q6DID3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scaf8Q6DID3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf8Q6DID3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms