Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp11bQ6DFW5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp11bQ6DFW5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms