Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Usp7Q6A4J8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp7Q6A4J8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Usp7Q6A4J8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Usp7Q6A4J8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp7Q6A4J8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Usp7Q6A4J8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms