Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms