Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msl2Q69ZF8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Msl2Q69ZF8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msl2Q69ZF8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms