Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zcchc2Q69ZB8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc2Q69ZB8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms