Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf280dQ68FE8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf280dQ68FE8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf280dQ68FE8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms