Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CltcQ68FD5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CltcQ68FD5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CltcQ68FD5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms