Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprdQ64487 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprdQ64487 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprdQ64487 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms