Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pan3Q640Q5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pan3Q640Q5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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