Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PatjQ63ZW7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PatjQ63ZW7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PatjQ63ZW7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms