Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Polr2kQ63871 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Polr2kQ63871 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Polr2kQ63871 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Polr2kQ63871 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Polr2kQ63871 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Polr2kQ63871 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Polr2kQ63871 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Polr2kQ63871 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Polr2kQ63871 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Polr2kQ63871 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Polr2kQ63871 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Polr2kQ63871 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Polr2kQ63871 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms