Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vil1Q62468 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vil1Q62468 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Vil1Q62468 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms