Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp1Q62442 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms