Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpd52Q62393 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52Q62393 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms