Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpcQ62241 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpcQ62241 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms