Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Lrrn1Q61809 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Lrrn1Q61809 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Lrrn1Q61809 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrn1Q61809 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms