Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grik5Q61626 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms