Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AlcamQ61490 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AlcamQ61490 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AlcamQ61490 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AlcamQ61490 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlcamQ61490 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlcamQ61490 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlcamQ61490 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlcamQ61490 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlcamQ61490 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AlcamQ61490 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlcamQ61490 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlcamQ61490 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlcamQ61490 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlcamQ61490 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlcamQ61490 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AlcamQ61490 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms