Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Msi1Q61474 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msi1Q61474 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Msi1Q61474 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Msi1Q61474 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msi1Q61474 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms