Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nell2Q61220 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nell2Q61220 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nell2Q61220 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nell2Q61220 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nell2Q61220 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nell2Q61220 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nell2Q61220 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nell2Q61220 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nell2Q61220 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nell2Q61220 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms