Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc6Q61143 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc6Q61143 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms