Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf4bQ61136 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf4bQ61136 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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