Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NinQ61043 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NinQ61043 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NinQ61043 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NinQ61043 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NinQ61043 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NinQ61043 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NinQ61043 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinQ61043 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinQ61043 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinQ61043 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinQ61043 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinQ61043 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinQ61043 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinQ61043 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinQ61043 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NinQ61043 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NinQ61043 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NinQ61043 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NinQ61043 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NinQ61043 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NinQ61043 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NinQ61043 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NinQ61043 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NinQ61043 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NinQ61043 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NinQ61043 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NinQ61043 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NinQ61043 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NinQ61043 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NinQ61043 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NinQ61043 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NinQ61043 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NinQ61043 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NinQ61043 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NinQ61043 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NinQ61043 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NinQ61043 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NinQ61043 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NinQ61043 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NinQ61043 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NinQ61043 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NinQ61043 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NinQ61043 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NinQ61043 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NinQ61043 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinQ61043 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinQ61043 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NinQ61043 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinQ61043 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinQ61043 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinQ61043 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NinQ61043 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NinQ61043 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NinQ61043 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NinQ61043 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NinQ61043 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NinQ61043 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NinQ61043 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NinQ61043 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NinQ61043 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NinQ61043 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NinQ61043 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NinQ61043 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NinQ61043 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NinQ61043 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NinQ61043 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NinQ61043 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NinQ61043 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NinQ61043 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NinQ61043 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NinQ61043 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NinQ61043 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NinQ61043 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NinQ61043 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NinQ61043 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NinQ61043 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NinQ61043 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NinQ61043 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NinQ61043 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NinQ61043 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NinQ61043 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NinQ61043 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NinQ61043 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NinQ61043 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NinQ61043 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NinQ61043 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NinQ61043 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NinQ61043 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NinQ61043 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NinQ61043 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NinQ61043 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NinQ61043 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NinQ61043 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NinQ61043 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NinQ61043 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NinQ61043 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NinQ61043 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NinQ61043 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NinQ61043 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms