Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxg1Q60987 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxg1Q60987 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms