Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms