Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Grik1Q60934 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grik1Q60934 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grik1Q60934 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms