Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DbpQ60925 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DbpQ60925 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DbpQ60925 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DbpQ60925 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DbpQ60925 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DbpQ60925 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms