Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf8Q60846 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf8Q60846 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms