Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot7Q60809 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot7Q60809 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnot7Q60809 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnot7Q60809 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnot7Q60809 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnot7Q60809 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms